Calleja bol organizátorom a šéfom centrálnej armády (1810-12) počas vojny za nezávislosť a šesťdesiatym miestodržiteľom Nového Španielska, vládol v rokoch 1813 až 1816 a bol jedným z veľkých darebákov v histórii Mexika.
Narodil sa v Medina del Campo vo Valladolide a zomrel vo Valencii. Prvú kampaň uskutočnil ako podporučík v nešťastnej alžírskej výprave, ktorú za vlády Karola III. Viedol gróf O'Reilly. Bol učiteľom a kapitánom spoločnosti so 100 kadetmi vrátane Joaquína Blacka, regenta po Španielsku, a Francisca Javiera de Elío, budúceho miestodržiteľa v Buenos Aires, na vojenskej škole v Puerto de Santa María.
Do Nového Španielska pricestoval s druhým grófom z Revillagigedo (1789) ako kapitán pri pevnom pešom pluku v Pueble a úspešne vykonával niekoľko komisií, kým nebol vymenovaný za veliteľa brigády San Luis Potosí. Mal tam pod svojim velením kantón vojsk, ktorému nariadil zhromaždenie miestokráľ Marquina, ktorého sa so svojou spoločnosťou zúčastnil kapitán Ignacio Allende. Tam sa tiež oženil s Doñou Franciscou de la Gándarou, dcérou kráľovského práporčíka tohto mesta, ktorá bola majiteľkou veľkej Haciendy de Bledos; a získal veľký vplyv na obyvateľov krajiny, ktorí ho poznali ako „majstra Dona Félixa“.
Keď došlo k povstaniu Hidalga, bez čakania na rozkazy miestodržiteľa, dal vojská svojej brigády na zbrane, zväčšil ich novými a organizoval ich a disciplinoval, vytvoril malú (4 000 mužov), ale mocnú armádu strediska, ktorá dokázala poraziť Hidalgo a postavte sa hrozivej ofenzíve, ktorú zahájil Morelos.
Calleja, ktorý bol na dôchodku v Mexiku po obliehaní Cuautly (máj 1812), mal vo svojom bydlisku (Casa de Moncada, neskôr Palacio Iturbide) svoj malý súd, na ktorom bola nespokojnosť s vládou Venegasu, ktorú obviňovali z nedostatku peňazí a bezmocný potlačiť a ukončiť revolúciu. Asi o 4 roky neskôr vládol krajine ako miestodržiteľ. Dokončil armádu tým, že dosiahol 40 000 mužov líniových vojsk a provinčných milícií a toľko monarchistov sa organizovalo vo všetkých mestách a panstvách, pričom obaja väčšinou opúšťali provincie, ktoré boli v revolúcii; reorganizoval štátnu pokladnicu, ktorej produkty sa zvýšili s novými daňami; obnovila obchodnú dopravu s častými kolónami, ktoré opäť premávali z jedného konca kráľovstva na druhý a s pravidelnou poštovou službou; a zvýšila výkonnosť a colné produkty.
To predpokladá neustále a intenzívne kampane, ktoré propagoval proti povstalcom, v ktorých Morelos podľahol. Odhodlaný a bezohľadný muž sa nezastavil v médiách a nezatváral oči pred zneužívaním, ktorého sa dopúšťali jeho velitelia, ak s horlivosťou slúžili skutočnej veci. Stal sa tak nenávistným voči svojim súčasníkom.
Po návrate do Španielska získal titul grófa z Calderónu (1818) a veľké kríže Isabel la Católica a San Hermenegildo. Potom, čo bol generálnym kapitánom Andalúzie a guvernérom Cádizu, velil nad expedičnými jednotkami v Južnej Amerike, ktoré pred odchodom povstali a uväznili ho (1820). Prepustený na slobodu, odmietol vládu Valencie a opäť bol uväznený na Malorke až do roku 1823. „Vyčistený“ v roku 1825 zostal v kasárňach vo Valencii až do svojej smrti.
