Rehoľníci, ktorí vstúpili na neobývané územia na severe Nového Španielska, mali myšlienku obrátiť „barbarské“ národy na kresťanstvo a tým ich tiež začleniť do politického života, aby neskôr našli školy a mestá v dedinách, ktoré predtým ustanovili.
Na dosiahnutie týchto cieľov sa rodičia vždy sprevádzaní ozbrojenými skupinami obrátili na pohanov a ponúkli im ochranu zo strany cirkvi a španielskej koruny výmenou za získanie kresťanského vzdelania. Indiáni, ktorí to prijali, sa zhromaždili, aby vytvorili misiu, stali sa útočiskom indiánov a miestom, kde sa mohli naučiť európske techniky poľnohospodárstva a iných remesiel.
Po ukončení pacifikácie sa misia stala novým mestom s kostolom. Misionári sa presunuli inam, aby znovu zahájili evanjelizačnú činnosť. Tento systém bol riskantný, pretože severní Indiáni určite kládli určitý odpor, pretože boli nepriateľskejší než tí v strede a utiekli smerom k horám.
Konverzia fungovala na základe ocenenia pozemkov a ochrany pre Indiánov výmenou za poslušnosť. Tí, ktorí boli proti, boli potrestaní, zatiaľ čo tí, ktorí organizovali povstania, boli popravení.
Po zhromaždení domorodého kmeňa bolo integrované hlavné jadro alebo hlava, ktoré pozostávalo z niekoľkých miest a dedín, ktoré mu podliehali. Misionári sídlili na horných tokoch riek a mali na starosti najmenej dve hosťujúce dediny. Traja a viac misionárov záviseli od rektora a miestneho návštevníka. Tieto zariadenia spolu vytvorili provinciu.
Najskôr bol postavený kamenný kostol a okolo neho boli postavené domy pre mníchov, ktorí sa chystali evanjelizovať, slnko, kocky a domorodé rodiny a spravidla škola. V podnikoch existovala čosi, čo by sme mohli nazvať primitívnou ekonomickou štruktúrou. Mali plochy na obrábanie, sejbu pôdy, otváranie ciest a zavlažovacie kanály; chov hospodárskych zvierat, zeleniny a remeselnícka činnosť. Na školách sa vyučoval katechizmus, čítanie, písanie a hudba.
Postupom času boli niektoré misie úplne opustené kvôli rôznym udalostiam, ako napríklad vyhnanie jezuitov v roku 1767, šírenie chorôb spôsobených Španielmi, útoky „barbarských“ indiánov, poveternostné podmienky, veľké vzdialenosti a málo peňazí na ich údržbu. Niektoré sú dnes zachované ako kostoly a iné dnes tvoria veľmi dôležité populácie. Z niektorých misií je však známe iba miesto ich pôvodného umiestnenia a z iných zostali iba ruiny.
Jezuiti ustanovili misie v Baja California Norte and Sur, Sonora, Sinaloa, Chihuahua, severný Nayarit, časť Durango a Coahuila. Po ich odchode sa dominikáni usadili na sever od Baja California, zatiaľ čo františkáni evanjelizovali Tamaulipas a Nuevo León a nahradili misionárov z rádu Loyola v južnej časti Baja California, Sonora, Sinaloa, Chihuahua, Nayarit, Durango a Coahuila. V strede na severe, po vzbure Zacatecos - ktorá bránila františkánskym misiám v pokračovaní - sa domorodí obyvatelia zorganizovali do kláštorov.
V roku 1563 kapitán Francisco de Ibarra absolvoval turné po území, ktoré zahŕňa súčasný stav Sinaloa, a založil niekoľko miest. Tieto však trvali krátko a až v roku 1591 boli príkazmi guvernéra Nueva Vizcaya poverení evanjelizáciou regiónu jezuitskí otcovia Gonzalo de Tapia a Martín Pérez.
Rehoľníci prešli cez Sierra Madre Occidental v máji toho istého roku, vnikli cez Acaponetu v Nayarite a prešli cez Culiacán, aby sa dostali na miesto, kde 6. júna 1591 založili svoju prvú budovu: San Felipe de Sinaloa.
